Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRDQ9UH36 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRRDQ9UH36 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms