Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAE1Q9UBE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAE1Q9UBE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAE1Q9UBE0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms