Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3BQ9UBC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNMT3BQ9UBC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNMT3BQ9UBC3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms