Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RCOR3Q9P2K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RCOR3Q9P2K3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCOR3Q9P2K3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms