Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CXXC1Q9P0U4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CXXC1Q9P0U4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CXXC1Q9P0U4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms