Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN2Q9NZM3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN2Q9NZM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms