Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMOD3Q9NYL9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms