Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX56Q9NY93 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX56Q9NY93 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms