Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARHL2Q9NY43 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BARHL2Q9NY43 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms