Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH5Q9NX47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms