Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C1orf109Q9NX04 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf109Q9NX04 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms