Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRGBPQ9NV56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRGBPQ9NV56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRGBPQ9NV56 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRGBPQ9NV56 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MRGBPQ9NV56 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRGBPQ9NV56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms