Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLE3Q9NRF9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLE3Q9NRF9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms