Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLR9Q9NR96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR9Q9NR96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR9Q9NR96 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms