Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
UPF2Q9HAU5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UPF2Q9HAU5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms