Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC52A2Q9HAB3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC52A2Q9HAB3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms