Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIPK3Q9H422 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIPK3Q9H422 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIPK3Q9H422 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms