Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00597Q9H2U6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00597Q9H2U6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00597Q9H2U6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms