Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS11Q9H270 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS11Q9H270 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS11Q9H270 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS11Q9H270 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS11Q9H270 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms