Protein–RNA interactions for Protein: Q9H227

GBA3, Cytosolic beta-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBA3Q9H227 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GBA3Q9H227 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBA3Q9H227 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms