Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUSAP1Q9BXS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUSAP1Q9BXS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms