Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRRTQ9BXP5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRTQ9BXP5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRTQ9BXP5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms