Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VN1R3Q9BXE9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms