Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SDF4Q9BRK5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDF4Q9BRK5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms