Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIPSNAP1Q9BPW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPSNAP1Q9BPW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms