Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPA33Q99795 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPA33Q99795 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPA33Q99795 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPA33Q99795 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPA33Q99795 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPA33Q99795 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms