Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF12Q96QT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF12Q96QT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms