Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ALS2Q96Q42 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms