Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ROBO3Q96MS0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ROBO3Q96MS0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms