Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIPOR3Q96MK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIPOR3Q96MK2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms