Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf85Q96MD7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms