Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRRC1Q96M27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRRC1Q96M27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms