Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms