Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHDQ96IW2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms