Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMIM19Q96E16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms