Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL38Q96DV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL38Q96DV4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL38Q96DV4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms