Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RHBDF1Q96CC6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDF1Q96CC6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms