Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RUNDC1Q96C34 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RUNDC1Q96C34 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms