Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TNRQ92752 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRQ92752 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRQ92752 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TNRQ92752 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TNRQ92752 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNRQ92752 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNRQ92752 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TNRQ92752 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TNRQ92752 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TNRQ92752 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TNRQ92752 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TNRQ92752 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TNRQ92752 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNRQ92752 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNRQ92752 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNRQ92752 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNRQ92752 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TNRQ92752 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRQ92752 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TNRQ92752 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TNRQ92752 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNRQ92752 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNRQ92752 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TNRQ92752 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TNRQ92752 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TNRQ92752 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRQ92752 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRQ92752 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRQ92752 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRQ92752 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRQ92752 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TNRQ92752 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRQ92752 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRQ92752 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRQ92752 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRQ92752 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TNRQ92752 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms