Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TWIST2Q8WVJ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWIST2Q8WVJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWIST2Q8WVJ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TWIST2Q8WVJ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TWIST2Q8WVJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms