Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SSH3Q8TE77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSH3Q8TE77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SSH3Q8TE77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSH3Q8TE77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms