Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACVR1CQ8NER5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms