Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP38Q8NB14 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP38Q8NB14 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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