Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3Q8N5Y2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms