Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf62Q8N4C0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf62Q8N4C0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms