Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms