Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJD3Q8N144 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJD3Q8N144 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms