Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCE1Q8N0S2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCE1Q8N0S2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms