Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLX4Q8IY92 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLX4Q8IY92 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLX4Q8IY92 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms