Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNTN4Q8IWV2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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CNTN4Q8IWV2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CNTN4Q8IWV2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNTN4Q8IWV2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNTN4Q8IWV2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CNTN4Q8IWV2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CNTN4Q8IWV2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNTN4Q8IWV2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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